Säätiö on perustettu vuonna 1994 Helsingissä, Suomen moskeijoiden säätiön nimellä, rakentamaan, hallinnoimaan ja ostamaan moskeijoita, islamilaisia keskuksia ja hautausmaita, sekä rahoittamaan islamilaiset kulttuuriset projektit. Toiminnan uudistuksen myötä vuonna 2010 päätettiin ottaa uudeksi nimeksi Suomen Islamilainen Säätiö.
